但是由于土壤有机质缺乏，现在我们施入生物菌剂肥后，会导致生物菌剂进入土壤后，缺乏营养自己休眠或被有害病菌吞噬，导致生物菌菌剂肥施入土壤后效果不好。
由于生物菌肥厂家生产的微生物菌剂肥里添加的基质主要是让菌剂存活繁殖用的，但是进入土壤后随水冲施菌剂就成了没有管的孩子，缺乏生产需要的干粮，本来是可以通过土壤补充的，但是由于现在很多土壤有机质低，菌剂没有载体去分解，效果就不行了，为什么生物菌肥厂家不去解决这个问题呢？主要原因有
1、基质原料找不到，因为生物菌剂进入土壤后要想自带营养，需要有机质蛋白质含量高的，一般符合这个要求的需要用玉米、豆粕、淀粉混合而成，这样可以让菌剂与营养相互包裹，进入土壤后，菌剂会被这些营养包裹住，就不用担心缺乏干粮了，一般的菌肥厂家很难找到这样的原料。
2、成本利润问题，一般选用这些原料大幅提高了原料成本，如果价格不变肯定是赔钱，如果价格太高，客户不愿意，卖不出去也是不行。
因此要想生物菌剂肥效果好，一定要使用自带营养的生物菌冲施肥果根菌好菌剂肥，这类生物菌剂肥，技术及原料虽然要求高，因为资源优势好，成本相对能控制的很好，这类菌剂肥虽然相对价格高一点，但是使用后果实的产量及品质可以提高不少，一桶效果是一般菌剂肥的好几倍，这样相当于更省了，由于原料是粮食做基质，因此更安全效果持续稳定。
很多菌剂肥价格很低，但是用了不好，您说我们花那冤枉钱干什么呢？其实能解决问题才是根本，有时候看似成本高，其实成本比那些效果不好的还要低呢。
